在学院设置方面，塔夫茨大学由十个学院组成：

博雅学院

博雅学院和工学院是塔夫茨大学唯一两个同时授予本科和硕博士学位的学院。

工学院

20世纪80年代中期，校方运用募捐得来的一笔款项，兴建了一座营养研究中心、两座工程实验室、一所科学中心、和一座电脑设计实验室，使该校理工方面的实力也大大增强。

弗莱彻法律和外交学院

美国最古老和最富盛名的国际关系研究生院之一。同时，该学院也被认为是世界上在国际关系学领域最为重要的学院之一。该学院每年只招收大约265名研究生，并拥有30名终身教员，美国朝鲜政策特别代表斯蒂芬·博斯沃思是现任该学院的院长。

牙医学院

赛克勒生物医学科学院

医学院

塔夫茨新英格兰医学中心是塔夫茨大学医学院的主要教学医院，更是著名的生物医学研究中心。泰晤士高等教育和世界大学学术排名（ARWU）均将塔夫茨大学医学院列为世界最佳的临床医学院之一。另外，塔夫茨大学医学院也在《美国新闻与世界报道》中在医学研究中名列51名，在护理类研究中名列54名。

卡明斯兽医学院

新英格兰地区唯一一个兽医学院，仅提供硕士和博士教育。

杰拉尔德和弗里德曼营养科学与政策学院

杰拉尔德和弗里德曼营养科学与政策学院聚集了一批优秀的生物医学、临床、社会和行为科学家进行研究、教育，并在人类营养学领域久负盛名。

乔纳森·蒂施公民与公共服务学院和特殊教育学院

学校图书馆拥有超过100万多万册的图书和期刊藏量。设各完善的电脑教室、高科技的实验室、运动场和保健中心共廷成了塔夫茨大学庞大的办学机构。

塔夫茨大学于2000年接受ebay创始人彼埃尔·奥米迪亚捐赠的一千万美元，建立了一个旨在“教育活跃公民”的学院。并在乔纳森·蒂施捐赠为这个学院捐赠四千万美元之后，该学院于2006年改名为乔纳森·蒂施公民与公共服务学院。这个创举被称作“将公共服务变为每一个研究型大学的核心学术研究目标的一个伟大的尝试”。蒂施学院不授予任何学位，该学院主要任务是走出校园，去促进和支持建立一个全球性的、公民可以参与的社区服务、项目、研究和教学计划。

在全球化这个概念还没被人们广为接受时，塔夫茨大学的管理者们已经开始考虑怎样把自己的学生培养成世界公民。这所学校主要招收愿意到海外留学的学生，并在德国、智利、中国和加纳等国设有海外中心。学校招收新生时对外语要求很高，40%以上的学生三年级整个学年在海外度过，一些二年级学生和四年级学生也在海外学习。

在2011年美国新闻与世界报道大学排名，塔夫茨大学跻身于美国大学中20所最受欢迎的学校之一。塔夫茨大学本科申请录取率为18.7%（2013年），是2001年以来的最低。2013年录取学生的平均SAT分数为2176。